MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain N1-011A plasmid

Total Repeats: 2987

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022045	GCT	2	6	2538	2543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530313891
2	NC_022045	CTGT	2	8	2680	2687	0 %	50 %	25 %	25 %	530313891
3	NC_022045	T	7	7	2738	2744	0 %	100 %	0 %	0 %	530313891
4	NC_022045	CTT	2	6	2837	2842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313892
5	NC_022045	TCT	2	6	2911	2916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313892
6	NC_022045	ATCA	2	8	2934	2941	50 %	25 %	0 %	25 %	530313892
7	NC_022045	GAC	2	6	2942	2947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530313892
8	NC_022045	TGG	2	6	2954	2959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530313892
9	NC_022045	GATA	2	8	2993	3000	50 %	25 %	25 %	0 %	530313892
10	NC_022045	TGC	2	6	3091	3096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530313892
11	NC_022045	CCAT	2	8	3107	3114	25 %	25 %	0 %	50 %	530313892
12	NC_022045	GCC	2	6	3145	3150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530313893
13	NC_022045	AAT	2	6	3201	3206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313893
14	NC_022045	GCTT	2	8	3212	3219	0 %	50 %	25 %	25 %	530313893
15	NC_022045	A	6	6	3249	3254	100 %	0 %	0 %	0 %	530313893
16	NC_022045	TATT	2	8	3501	3508	25 %	75 %	0 %	0 %	530313894
17	NC_022045	GAA	2	6	3518	3523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530313894
18	NC_022045	T	6	6	3550	3555	0 %	100 %	0 %	0 %	530313894
19	NC_022045	AAC	2	6	3561	3566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530313894
20	NC_022045	AAAG	2	8	3594	3601	75 %	0 %	25 %	0 %	530313894
21	NC_022045	ATTAA	2	10	3627	3636	60 %	40 %	0 %	0 %	530313894
22	NC_022045	ATT	2	6	3642	3647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530313894
23	NC_022045	CT	3	6	3662	3667	0 %	50 %	0 %	50 %	530313894
24	NC_022045	CAT	2	6	3688	3693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313894
25	NC_022045	AAT	2	6	3713	3718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313894
26	NC_022045	TTGT	2	8	3738	3745	0 %	75 %	25 %	0 %	530313894
27	NC_022045	AGAAA	2	10	3755	3764	80 %	0 %	20 %	0 %	530313894
28	NC_022045	ATC	2	6	3768	3773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313894
29	NC_022045	AT	3	6	3781	3786	50 %	50 %	0 %	0 %	530313894
30	NC_022045	T	6	6	3788	3793	0 %	100 %	0 %	0 %	530313894
31	NC_022045	A	6	6	3797	3802	100 %	0 %	0 %	0 %	530313894
32	NC_022045	ATC	2	6	3834	3839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313894
33	NC_022045	ACC	2	6	3856	3861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530313894
34	NC_022045	TG	3	6	3906	3911	0 %	50 %	50 %	0 %	530313894
35	NC_022045	T	6	6	3942	3947	0 %	100 %	0 %	0 %	530313894
36	NC_022045	T	6	6	4150	4155	0 %	100 %	0 %	0 %	530313873
37	NC_022045	TAG	2	6	4191	4196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530313873
38	NC_022045	TAT	2	6	4212	4217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530313873
39	NC_022045	TGG	2	6	4267	4272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530313873
40	NC_022045	CAA	2	6	4320	4325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530313873
41	NC_022045	AAG	2	6	4347	4352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530313873
42	NC_022045	ACA	2	6	4373	4378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530313873
43	NC_022045	CAT	2	6	4390	4395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313873
44	NC_022045	CGG	2	6	4435	4440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530313873
45	NC_022045	AT	3	6	4546	4551	50 %	50 %	0 %	0 %	530313873
46	NC_022045	AAT	2	6	4736	4741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313873
47	NC_022045	TGGT	2	8	4758	4765	0 %	50 %	50 %	0 %	530313873
48	NC_022045	TGG	2	6	4831	4836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530313873
49	NC_022045	ATTC	2	8	4847	4854	25 %	50 %	0 %	25 %	530313873
50	NC_022045	ATT	2	6	4901	4906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530313873
51	NC_022045	TCT	2	6	4937	4942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313873
52	NC_022045	GAA	2	6	4949	4954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530313873
53	NC_022045	AGA	2	6	4975	4980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530313873
54	NC_022045	AGC	2	6	4981	4986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530313873
55	NC_022045	TGGT	2	8	5023	5030	0 %	50 %	50 %	0 %	530313873
56	NC_022045	CTT	2	6	5325	5330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313895
57	NC_022045	AAG	2	6	5345	5350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530313895
58	NC_022045	GAA	3	9	5377	5385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530313895
59	NC_022045	GAA	2	6	5454	5459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530313895
60	NC_022045	TTC	2	6	5536	5541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313895
61	NC_022045	TCT	2	6	5570	5575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313895
62	NC_022045	AGT	2	6	5632	5637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530313895
63	NC_022045	CAC	2	6	5706	5711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530313895
64	NC_022045	ATG	2	6	5726	5731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530313895
65	NC_022045	CGA	2	6	5741	5746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530313895
66	NC_022045	CAA	2	6	5862	5867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530313895
67	NC_022045	TG	3	6	5906	5911	0 %	50 %	50 %	0 %	530313895
68	NC_022045	ATA	2	6	5933	5938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313895
69	NC_022045	ACA	2	6	5972	5977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530313895
70	NC_022045	GTT	2	6	5989	5994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530313895
71	NC_022045	TTC	2	6	6049	6054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313895
72	NC_022045	AGA	2	6	6068	6073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530313895
73	NC_022045	CAA	2	6	6114	6119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530313895
74	NC_022045	ACT	2	6	6125	6130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313895
75	NC_022045	TGC	2	6	6163	6168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530313895
76	NC_022045	CAA	2	6	6192	6197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530313895
77	NC_022045	T	6	6	6205	6210	0 %	100 %	0 %	0 %	530313895
78	NC_022045	AGA	2	6	6264	6269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530313895
79	NC_022045	ACC	2	6	6313	6318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530313895
80	NC_022045	AGT	2	6	6367	6372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530313895
81	NC_022045	ATG	2	6	6453	6458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530313895
82	NC_022045	TCT	2	6	6500	6505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313895
83	NC_022045	AAGA	2	8	6530	6537	75 %	0 %	25 %	0 %	530313895
84	NC_022045	T	6	6	6583	6588	0 %	100 %	0 %	0 %	530313895
85	NC_022045	CTA	2	6	6630	6635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313895
86	NC_022045	CAG	2	6	6867	6872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530313896
87	NC_022045	ATT	2	6	6879	6884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530313896
88	NC_022045	CTA	2	6	6896	6901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313896
89	NC_022045	ACG	2	6	6972	6977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530313896
90	NC_022045	ACT	2	6	7007	7012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313896
91	NC_022045	GAAAAA	2	12	7025	7036	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	530313896
92	NC_022045	GAAA	2	8	7153	7160	75 %	0 %	25 %	0 %	530313896
93	NC_022045	AGC	2	6	7172	7177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530313896
94	NC_022045	ATT	2	6	7311	7316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530313897
95	NC_022045	CTA	2	6	7328	7333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313897
96	NC_022045	CAC	2	6	7403	7408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530313897
97	NC_022045	ACT	2	6	7439	7444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313897
98	NC_022045	ACA	2	6	7447	7452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530313897
99	NC_022045	AAAC	2	8	7466	7473	75 %	0 %	0 %	25 %	530313897
100	NC_022045	AT	3	6	7573	7578	50 %	50 %	0 %	0 %	530313897
101	NC_022045	AGC	2	6	7604	7609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530313897
102	NC_022045	A	6	6	7698	7703	100 %	0 %	0 %	0 %	530313897
103	NC_022045	GAACA	2	10	7729	7738	60 %	0 %	20 %	20 %	530313897
104	NC_022045	ATC	2	6	7777	7782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313897
105	NC_022045	TA	3	6	7867	7872	50 %	50 %	0 %	0 %	530313897
106	NC_022045	AGA	2	6	7873	7878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530313897
107	NC_022045	AAG	2	6	7885	7890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530313897
108	NC_022045	CT	3	6	7894	7899	0 %	50 %	0 %	50 %	530313897
109	NC_022045	ATT	2	6	7931	7936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530313897
110	NC_022045	TTTC	2	8	8043	8050	0 %	75 %	0 %	25 %	530313898
111	NC_022045	TTC	2	6	8113	8118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313898
112	NC_022045	T	6	6	8170	8175	0 %	100 %	0 %	0 %	530313898
113	NC_022045	AAT	2	6	8230	8235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313898
114	NC_022045	TTC	2	6	8236	8241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313898
115	NC_022045	AGG	2	6	8257	8262	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530313898
116	NC_022045	TC	4	8	8275	8282	0 %	50 %	0 %	50 %	530313898
117	NC_022045	ATA	2	6	8317	8322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313898
118	NC_022045	TCAT	2	8	8387	8394	25 %	50 %	0 %	25 %	530313898
119	NC_022045	GTA	2	6	8400	8405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530313898
120	NC_022045	TGC	2	6	8560	8565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530313899
121	NC_022045	TTC	2	6	8572	8577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313899
122	NC_022045	TCA	2	6	8633	8638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313899
123	NC_022045	ACC	2	6	8653	8658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530313899
124	NC_022045	AT	3	6	8679	8684	50 %	50 %	0 %	0 %	530313899
125	NC_022045	TTC	2	6	8689	8694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313899
126	NC_022045	GCA	2	6	8730	8735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530313899
127	NC_022045	TTC	2	6	8824	8829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313899
128	NC_022045	ATC	2	6	8836	8841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313899
129	NC_022045	GTTT	2	8	8872	8879	0 %	75 %	25 %	0 %	530313899
130	NC_022045	AAAT	2	8	8887	8894	75 %	25 %	0 %	0 %	530313899
131	NC_022045	A	7	7	8926	8932	100 %	0 %	0 %	0 %	530313899
132	NC_022045	CTT	2	6	8958	8963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313899
133	NC_022045	CTA	2	6	8964	8969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313899
134	NC_022045	TCGG	2	8	9046	9053	0 %	25 %	50 %	25 %	530313899
135	NC_022045	CTTT	2	8	9058	9065	0 %	75 %	0 %	25 %	530313899
136	NC_022045	TCTTG	2	10	9095	9104	0 %	60 %	20 %	20 %	530313899
137	NC_022045	TCA	2	6	9161	9166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313899
138	NC_022045	TTTC	2	8	9179	9186	0 %	75 %	0 %	25 %	530313899
139	NC_022045	CAT	2	6	9228	9233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313899
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141	NC_022045	CT	3	6	9323	9328	0 %	50 %	0 %	50 %	530313899
142	NC_022045	T	6	6	9328	9333	0 %	100 %	0 %	0 %	530313899
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150	NC_022045	CTTT	2	8	9739	9746	0 %	75 %	0 %	25 %	530313899
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154	NC_022045	T	7	7	9990	9996	0 %	100 %	0 %	0 %	530313899
155	NC_022045	T	6	6	9998	10003	0 %	100 %	0 %	0 %	530313899
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158	NC_022045	ATA	2	6	10094	10099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313900
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163	NC_022045	ACTA	2	8	10354	10361	50 %	25 %	0 %	25 %	530313900
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166	NC_022045	AT	3	6	10392	10397	50 %	50 %	0 %	0 %	530313900
167	NC_022045	A	7	7	10637	10643	100 %	0 %	0 %	0 %	530313901
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251	NC_022045	AATAC	2	10	14090	14099	60 %	20 %	0 %	20 %	530313905
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257	NC_022045	TG	3	6	14223	14228	0 %	50 %	50 %	0 %	530313906
258	NC_022045	TGT	2	6	14321	14326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530313906
259	NC_022045	T	6	6	14326	14331	0 %	100 %	0 %	0 %	530313906
260	NC_022045	TG	3	6	14356	14361	0 %	50 %	50 %	0 %	530313906
261	NC_022045	TTC	2	6	14378	14383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313906
262	NC_022045	GTT	2	6	14422	14427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530313906
263	NC_022045	AAT	2	6	14444	14449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313906
264	NC_022045	ATTG	2	8	14453	14460	25 %	50 %	25 %	0 %	530313906
265	NC_022045	TTCT	2	8	14486	14493	0 %	75 %	0 %	25 %	530313906
266	NC_022045	TAA	2	6	14581	14586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313907
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391	NC_022045	TGA	2	6	20469	20474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530313913
392	NC_022045	T	6	6	20489	20494	0 %	100 %	0 %	0 %	530313913
393	NC_022045	T	8	8	20500	20507	0 %	100 %	0 %	0 %	530313913
394	NC_022045	CAT	2	6	20614	20619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313914
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396	NC_022045	ACT	2	6	20790	20795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313915
397	NC_022045	CT	3	6	20905	20910	0 %	50 %	0 %	50 %	530313915
398	NC_022045	CTG	2	6	20951	20956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530313915
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